对于中小型网站来说，紧密围绕主题的三层结构是最有效的（如觉得自己网站信息量很大，想要建设四层结构的，也不是不可以）。三层结构网站有利于捜索引擎蜘蛛收录和抓取更多有价值的网页。同时，此类结构给访客提供了方便。一个用户体验度差，结构混乱的网站会让访客找不到北，从而快速结束访问。
三层结构第一层是首页。第二层页面从属于首页，一般是5到6页或者7到8页。第三层页面(众多）从属于第二层。首页（第一层）使用的是网站主题关键词。第二层使用的是主要关键词。第三层使用的是一般关键词。每一页都是围绕一个关键词来完成, 可以使用免费的谷歌关键词排名工具。大家也可以使用其它关键词工具来挑选合适的关键词为第二层、第三层页面关键词做准备。最重要的是每一页都是有质量的内容，紧密围绕话题（一个关键词），满足访客寻找有关信息的需求。
网站结构
对于一个特定的关键词，可以写一篇文章。对于一个很重要的关键词，可以写很多篇文章。比如，某个重要的关键词可以写十到二十篇的文章。对，就围绕同一个关键词。当然每一篇文章的角度不一样，提供了不同的内容，解决了访客不同的问题。用同一个关键词写了二十篇不同的文章，不要以为那十九篇是浪费了，访客在谷歌或其它捜索引擎中捜索其它关键词包括大量长尾关键词会找到这些网页。
首页链接多个第二层页面，第二层页面反向链接到首页，首页得到了加强。第二层页面链接到相关的第三层页面，相关的第三层页面反向链接到相关的第二层页面，第二层页面得到了加强。第三层全部页面反向链接到首页。从而，首页得到了进一步的加强。相关的第二层页面间可互相链接。相关的第三层页面间也建议互相链接。
链接的方式：首页链接到第二层页面可以用快速导航和首页内链（文章中文字指向第二层的某个页面）。上节说到的其它链接可用在页面下部相关文章阅读的形式出现。当然，用文章内裢，关键词指向其他层面的文章也是个好方法。内部链接最好做成开窗式的，当读者在文章中点击某个链接，被链接的页面打开了一个新的页面。访客原来看的文章还在，没有被关闭。
导航结构
我们可以试想一下一个大型超巿的结构。超巿本身是第一层，是一个主题：超市是满足家庭消费品需要的场所。超市的各部门是属于第二层结构：服装、电器用品、熟食、冷冻食品，水果等等。某个部门下面分成许多商品，这是第三层。网站的大部分页面都是第三层网页，就象超市的具体商品一样。当访客进入网站首页，他们很容易看到网站提供一些什么样的分类信息，很清楚点击哪一处到哪里去，就象走进超市先找大的类别，走进某一大类别之后，就容易找到具体的商品了。